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DNA采血卡中的DNA質(zhì)量分析
用相對(duì)于外部和內(nèi)部標(biāo)準(zhǔn)的分析方法對(duì)純化的DNA補(bǔ)體進(jìn)行定量分析，并記錄為總得率(ng/和DNA質(zhì)量濃度(ng/ul)。雙鏈DNA是一種特異的雙鏈DNA，為雙鏈DNA的含量提供了準(zhǔn)確的測(cè)量方法。DNA片段長(zhǎng)度用100 ng DNA電泳測(cè)定,預(yù)鑄0.8%(E-凝膠，E-凝膠)或短、擴(kuò)增DNA樣品(1.2%)。在所有情況下，每個(gè)純化樣品的100納克被裝載在每條凝膠車道上，并與相同數(shù)量的DNA標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行比較，已知質(zhì)量在100 kb-200 kb范圍內(nèi)。在0.8%的凝膠分析中，長(zhǎng)度大于40 kb的DNA片段將以單個(gè)折疊帶的形式遷移，相對(duì)于高分子量標(biāo)準(zhǔn)，可用于估計(jì)大于40 kb的未知樣品的含量。在1.2%的凝膠上，長(zhǎng)度大于10 kb的DNA片段將以單個(gè)折疊帶的形式遷移，這是對(duì)樣本中大于10 kb的那一部分的估計(jì)。
從DNA采血卡片中提取的5 ul-10 ul樣品中，大約有50%的樣品足夠集中用于分析。1ng(約占純化DNA樣品的0.5%)從每個(gè)樣本中進(jìn)行全基因組擴(kuò)增，采用基于-聚合酶鏈反應(yīng)的全基因組擴(kuò)增技術(shù)，根據(jù)制造商的協(xié)議，在表達(dá)分析控制下進(jìn)行全基因組擴(kuò)增。將得到的全基因組擴(kuò)增產(chǎn)物稀釋至50 ng/ul，用于610 ng/UL的分析。
深加工610分析
每個(gè)樣本200份，用表達(dá)分析實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行分析。簡(jiǎn)單地說(shuō)，所有的DNA采血卡樣本都是在改造平臺(tái)上進(jìn)行分析的，并進(jìn)行了初步的統(tǒng)計(jì)分析，生成了一個(gè)用于評(píng)估數(shù)據(jù)質(zhì)量的標(biāo)準(zhǔn)指標(biāo)-更高的呼叫率。在Cm 610平臺(tái)上對(duì)全基因組擴(kuò)增樣品進(jìn)行檢測(cè)，并采用標(biāo)準(zhǔn)方法對(duì)其進(jìn)行配對(duì)分析。
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